Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms