Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ubash3bQ8BGG7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubash3bQ8BGG7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms