Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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