Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zbed4Q80WQ9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zbed4Q80WQ9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zbed4Q80WQ9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zbed4Q80WQ9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Zbed4Q80WQ9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Zbed4Q80WQ9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Zbed4Q80WQ9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Zbed4Q80WQ9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zbed4Q80WQ9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Zbed4Q80WQ9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Zbed4Q80WQ9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms