Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Dsg1bQ7TSF1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Dsg1bQ7TSF1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Dsg1bQ7TSF1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Dsg1bQ7TSF1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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