Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Dsg1cQ7TSF0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms