Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rph3alQ768S4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3alQ768S4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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