Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trpv1Q704Y3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms