Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmeff1Q6PFE7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tmeff1Q6PFE7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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