Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zbtb40Q6PCS8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms