Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp49Q6P9L4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp49Q6P9L4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms