Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smchd1Q6P5D8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms