Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sohlh1Q6IUP1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms