Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarca2Q6DIC0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms