Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Q6DFW0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms