Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja3Q64448 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja3Q64448 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms