Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Zfp248Q640N4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zfp248Q640N4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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