Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc18Q640L5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms