Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sall3Q62255 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms