Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sycp1Q62209 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp1Q62209 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms