Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim25Q61510 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim25Q61510 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim25Q61510 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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