Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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PcolceQ61398 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PcolceQ61398 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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