Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Mre11Q61216 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mre11Q61216 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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