Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psme4Q5SSW2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms