Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp18Q5SSI6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp18Q5SSI6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms