Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sun3Q5SS91 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sun3Q5SS91 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms