Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc1Q5NCF2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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