Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx25Q3ZT31 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms