Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Znf48Q3US17 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Znf48Q3US17 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms