Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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