Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Tmem253Q3UNB8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms