Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp30Q3UN04 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp30Q3UN04 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp30Q3UN04 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp30Q3UN04 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp30Q3UN04 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Usp30Q3UN04 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp30Q3UN04 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp30Q3UN04 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Usp30Q3UN04 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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