Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc33Q3ULW6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc33Q3ULW6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms