Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

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Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Usp19Q3UJD6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp19Q3UJD6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Usp19Q3UJD6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp19Q3UJD6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms