Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trafd1Q3UDK1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trafd1Q3UDK1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms