Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Parp8Q3UD82 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms