Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf166Q3U9F6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf166Q3U9F6 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf166Q3U9F6 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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