Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
YrdcQ3U5F4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
YrdcQ3U5F4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms