Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kdm4dQ3U2K5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kdm4dQ3U2K5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms