Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

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Length 965 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tbc1d2bQ3U0J8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tbc1d2bQ3U0J8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Tbc1d2bQ3U0J8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tbc1d2bQ3U0J8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tbc1d2bQ3U0J8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms