Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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