Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp39Q3TIX9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp39Q3TIX9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp39Q3TIX9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms