Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3ip1Q149C2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms