Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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Ttc39dQ0VF76 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ttc39dQ0VF76 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms