Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxc4Q08624 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms