Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Speer6-ps1-203ENSMUST00000223482 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Siah2Q06986 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms