Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sox10Q04888 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms