Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms