Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccl7Q03366 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms