Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms